BIOS3011 – Bioinformatikk i teams
Kort om emnet
Dagens molekyl?rbiologiske metoder produserer datamengder som krever spesialiserte beregningsverkt?y for ? kunne forst?s og analyseres. Disse gj?r det mulig ? angripe problemer innen livsvitenskapene som inntil nylig ble ansett som ul?selige. I dette emnet l?rer du om sentrale temaer, teorier og verkt?y i bioinformatikk. Du jobber problembasert i grupper med ? utvikle kode for ? analysere og tolke biologiske sekvenser.
Hva l?rer du?
Etter ? ha tatt dette emnet
- Kan du 澳门皇冠体育,皇冠足球比分e om utvikling av kode i grupper ved bruk av verkt?y og metoder for versjonskontroll og deling av kode
- Kan du forklare og diskutere egen og andres bioinformatikk-kode
- Kan sammenstille og analysere nukleotid- og aminosyresekvenser for ? gi grunnleggende funksjonell og evolusjon?r informasjon
- Kan du forklare de teoretiske og statistiske prinsippene som ligger til grunn for biologisk sekvensanalyse og vanlige algoritmer i bioinformatikk
- Kan du bruke programmering til ? implementere grunnleggende algoritmer og verkt?y relevante for bioinformatikk
- Kan du sette opp bioinformatiske arbeidsflyter (pipelines) av begrenset omfang ved hjelp av systemer for arbeidsflyth?ndtering
- Kan du utf?re enkle analyser og tolke datasett fra dypsekvenseringsteknologier
Opptak til emnet
Studenter m? hvert semester?s?ke og f? plass p? undervisningen og melde seg til eksamen?i Studentweb.
Prioritet vil bli gitt til studenter p? bachelorprogrammet i biovitenskap.
Spesielle opptakskrav
I tillegg til generell studiekompetanse eller realkompetanse m? du dekke spesielle opptakskrav.
Du m? ha:
- Matematikk R1 (eller Matematikk S1 + S2)
Og en av disse:
- Matematikk R2
- Fysikk (1+2)
- Kjemi (1+2)
- Biologi (1+2)
- Informasjonsteknologi (1+2)
- Geofag (1+2)
- Teknologi og forskingsl?re (1+2)
Matematikk R2 var et krav til og med studie?ret 2021/2022 som del av en fors?ksordning. Fra og med studie?ret 2022/2023 er det ikke lenger et krav med matematikk R2.
De spesielle opptakskravene kan ogs? dekkes med fag fra videreg?ende oppl?ring f?r Kunnskapsl?ftet, eller p? andre m?ter. Les mer om spesielle opptakskrav.
Obligatoriske forkunnskaper
Element?re forkunnskaper i programmering, tilsvarende innholdet i BIOS1100 – Innf?ring i beregningsmodeller for biovitenskap (nedlagt).
Anbefalte forkunnskaper
BIOS1110 – Celle- og molekyl?rbiologi og STK1000 – Innf?ring i anvendt statistikk
Undervisning
- Forelesninger med live-koding
- Organisert ?ving i gruppe med hjelpel?rer (obligatorisk de f?rste to ukene)
- Selvstendig gruppearbeid med obligatoriske innleveringer der en hjelpel?rer er tilgjengelig (obligatorisk oppm?te de f?rste to ukene)
Obligatoriske aktiviteter m? v?re godkjent for ? kunne g? opp til eksamen.?
Det er obligatorisk oppm?te til f?rste forelesning for studenter som skal f?lge undervisning i emnet. Dette gjelder?ogs? for studenter p? venteliste. Du mister plassen p? emnet dersom?forfall til f?rste forelesning ikke er meldt til studieseksjonen studieinfo@ibv.uio.no, f?r forelesningen starter.
Adgang til undervisning: Dersom du har?gjennomf?rt og f?tt godkjent obligatorisk undervisning, har du ikke krav p? ny undervisning. Dersom du har f?tt undervisningsopptak til emnet, men ikke har gjennomf?rt eller f?tt godkjent obligatorisk undervisning, har du?rett til ny undervisning n?r det er ledig?kapasitet.
Eksamen
Endelig karakter fastsettes basert p? poengsystem (0-100 poeng), som sammenfatter resultater fra midtveiseksamen, obligatoriske innleveringer, og avsluttende muntlig eksamen (gruppepresentasjon).
- 2 gruppevise innleveringer (godkjent/ikke-godkjent). For hver av de to innleveringene gis gruppedeltakerne 5 poeng dersom gruppen leverer godkjent oppgave til oppsatt tid. Tot. 10 poeng.
- Midtveiseksamen (skriftlig skoleeksamen) gir opptil 50 poeng
- Avsluttende muntlig eksamen som gruppepresentasjon. Gir opptil 40 poeng (30 poeng gruppevis, 10 poeng individuelt)
Hjelpemidler til eksamen
Kalkulator i Inspera
Eksamensspr?k
Du kan besvare eksamen p? norsk, svensk, dansk eller engelsk.
Karakterskala
Emnet bruker karakterskala fra A til F, der A er beste karakter og F er stryk. Les mer om karakterskalaen.
Adgang til ny eller utsatt eksamen
Studenter som dokumenterer gyldig frav?r fra ordin?r eksamen, kan ta?utsatt eksamen i starten av neste semester.
Det tilbys ikke ny eksamen til studenter som har trukket seg under ordin?r eksamen, eller som ikke har best?tt.
Mer om eksamen ved UiO
- Kildebruk og referanser
- Hvordan bruke KI som student
- Tilrettelegging p? eksamen
- Trekk fra eksamen
- Syk p? eksamen / utsatt eksamen
- Begrunnelse og klage
- Ta eksamen p? nytt
- Fusk/fors?k p? fusk
Andre veiledninger og ressurser finner du p? fellessiden om eksamen ved UiO.